波士顿属于大陆性气候。但濒临大西洋，气候也明显受到海洋的影响，沿海地区的气候要比内陆地区温和很多。在波士顿很少发生极冷或极热的的现象。在冬天，低温开始于十一月，但是由于大洋的影响也不会很冷，在四月就开始回暖。尽管在夏天，波士顿会比较热，但是高温很快就会被来自东海岸的海风吹走，随之而来的是一阵凉爽的海风。沿海的地理位置，使得波士顿没有旱季，贯穿全年都有降水，尤其是在夏季与初秋季节雨量比较大。但是在近海岸地区每个月都会经历大雾天气。波士顿11月下旬到三月末是气温最低的时候，温度最高的是七月和八月。而感觉最舒适的是春季和秋季，也就是四月到六月、九月到十一月中旬期间。波士顿曾被评为美国最适合居住的六个城市之一。
波士顿的春天可能变得很热，气温升到华氏90度；但也可能到5月下旬还很寒冷，只有华氏40度，由于寒冷的海水。最热的月份在7月，平均气温为27.7℃，最低气温为18.4℃，通常很潮湿。最冷的月份是1月，平均气温为35.8华氏度（2.1℃），最低气温为21.6华氏度(-5.6℃）。夏季气温超过90华氏度，冬季气温低于10华氏度并不罕见，但很少会持续多日。记录的最高气温是1911年 7月4日的104华氏度（40摄氏度）,有记录的最低气温是1934年2月9日的-18华氏度（-28摄氏度）。该市年平均降雨量为42英寸（108毫米），平均降雪正好也是42英寸（108厘米），远高於远离该市的内陆地区。马萨诸塞伸入北大西洋的地理位置也使它极易受东北风影响，一次暴风雪就可能降雪超过20英寸（50厘米）。热带风暴或飓风偶尔也会袭击该地区，特别是在初秋。